Thực hiện Kế hoạch số 3159/KH-SGD&ĐT Hà Nội ngày 22/8/2016 về công tác ATTP ngành GD&ĐT Hà Nội năm học 2016-2017; Kế hoạch 267/KH-UBND ngày 30/8/2016 của UBND quận Long Biên về thực hiện trật tự văn minh đô thị, an toàn thực phẩm trong các trường học trên địa bàn quận Long Biên năm học 2016 - 2017. Nhận thức được tầm quan trọng của việc giữ gìn VSATTP cho học sinh, ngay từ đầu năm học, nhà trường đã thực hiện ký kết hợp đồng thực phẩm với các công ty có đủ tư cách pháp nhân, được cơ quan y tế xác nhận đủ điều kiện về VSATTP tại công văn số 1549/UBND-YT ngày 24/8/2016 và công văn số 509/TB-YT của UBND quận Long Biên.
Ngoài thực phẩm an toàn, quy trình chế biến cũng phải đảm bảo an toàn. Do vậy, nhà trường đã xây dựng bếp ăn theo quy trình một chiều được cấp giấy chứng nhận đủ điều kiện VSATTP. Đồng thời, khu vực bếp cũng như các dụng cụ chế biến luôn được đảm bảo vệ sinh. 100% nhân viên nuôi dưỡng được tập huấn kiến thức về đảm bảo VSATTP và được khám sức khỏe định kỳ. Thực đơn của trẻ được thay đổi hàng ngày và đảm bảo đủ dinh dưỡng theo lứa tuổi.
Nhờ thực hiện tốt công tác đảm bảo VSATTP mà trong nhiều năm qua, trường mầm non Hoa Sen không có trường hợp ngộ độc thực phẩm nào xảy ra. Nhà trường luôn đảm bảo dinh dưỡng cho trẻ để trẻ có đủ sức khỏe học tập và vui chơi.